바이오인

출처 : NIH 미국 국립보건원 

국립보건원이 이끈 연구자들은 신약개발을 촉진할 수 있는 소프트웨어를 개발

□ 국립보건원 연구자 Teresa Przytycka 박사가 이끄는 연구자 팀은 관심이 있는 목표에 높은 정확도를 가지고 결합하는 분자들을 확인하기를 원하는 신약개발자 및 다른 과학자들을 위한 중요한 진전이 될 수 있는 AptaTRACE라고 불리는 새로운 소프트웨어 도구를 개발

  ㅇ 국립보건원 산하 국립의학도서관 국립 생명공학정보센터의 선임연구자인 Przytycka 박사는 이번 연구는 어떻게 빅데이터의 혜택들이 이러한 데이터를 정보로 변환 가능한 알고리즘의 존재에 중요하게 의존하는지에 대한 우수한 사례라고 언급

□ 앱타머는 다양한 생물학적 목표에 높은 친화성과 특이성을 가지고 결합할 수 있는 짧은 RNA 또는 DNA 분자들

  ㅇ 앱타머들은 목표 표면의 생화학적 특징들에 상보적인 그들의 서열과 구조 특성 때문에 그들의 목표에 결합

  ㅇ 앱타머들의 가능한 목표로는 작은 유기분자들, 단백질들 또는 단백질 결합체들, 바이러스 표면들 및 전체 세포들을 포함

  ㅇ 목표들의 이러한 광범위한 범위는 분자적인 바이오센서들로부터 약물 전달 시스템 및 항체 교체까지 넓은 응용에 활용 가능

□ AptaTRACE는 엡타머들을 확인할 수 있는 실험실 기술인 급격한 촉진에 의한 리간드 고효율 체계적인 진화(HT-SELEX*)와 함께 사용되도록 설계

    * High-Throughput Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment

  ㅇ HT-SELEX는 목표에 결합할 수 있는 후보물질을 확인하기 위하여 수백만 서열들의 분석을 허용

□ AptaTRACE 도구는 결합하는 서열들 중에서 공통된 특징을 찾기 위해 이런 데이터를 분석

□ AptaTRACE는 목표에 결합하는 엡타머들의 서열 및 구조 특성들을 획득하기 위하여 수많은 선택 과정들로부터 서열 데이터 전체를 이용하는 최초의 알고리즘

  ㅇ 이러한 정보들은 왜 일부 분자들은 결합하고 나머지들은 결합하지 않는지를 연구자들이 보다 잘 이해하도록 함

  ㅇ 이러한 결합부위들의 이해는 특정한 세포를 목표로 하는 약물전달 시스템에 엡타머를 이용하는 것과 같은 변화를 가능하게 하기 위해서 HT-SELEX 과정을 통해 확인된 엡타머를 이용하는데 필수적

  ㅇ AptaTRACE를 기술하는 연구는 Cell Systems의 7월 27일 호에 게재

□ AptaTRACE는 Przytycka 박사 집단, John Burnett 박사가 이끄는 캘리포니아 Duarte 소재 City of Hope Beckman 연구소의 연구자들과 Rolf Backofen 박사가 이끄는 독일 Breisgau 소재 Freiburg 대학교 연구자들의 협력의 결과

  ㅇ 이 도구는 Cell Systmes와 함께 국립 생명공학정보센터 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Przytycka/index.cgi#aptatools에서 다운로드 가능

★ 국립 생명공학정보센터
 
  - 분자생물학 분야의 공공데이터베이스를 만들고 계산생물학 연구를 수행하며 분자 및 게놈 데이터를 분석하기 위한 소프트웨어를 개발하고 의과학정보를 보급
 
  - 사람의 건강과 질환에 영향을 미치는 과정들에 대한 보다 나은 이해를 추구
 
  - 국립 생명공학정보센터는 국립 의학도서관 산하로 보다 많은 정보가 필요하면 http://www.ncbi.mlm.nih.gov를 방문

★ 국립 의학도서관
 
  - 전세계에서 가장 큰 의과학 도서관으로 전세계에 걸쳐 수백만명에 의해 매년 수십억 회에 걸쳐 검색되는 다양한 주제에 대한 출력물 및 전자 정보 자원들을 구축?유지
 
  - 또한 의과학 정보학 및 의료 정보 기술분야의 연구, 개발 및 연수를 지원하고 직접수행
 
  - 추가적인 정보는 www.nlm.nih.gov에서 검색

★ 미 국립보건원에 대하여 : 미 국립보건원은 국가에서 설립한 의료 연구기관으로 27개 연구소와 센터로 구성

 - 기초, 임상 및 중개 의료 연구를 지원하는 주요 연방기관이며 질환들의 원인, 대처 및 치료를 연구

 - 보다 많은 정보가 필요한 경우 www.nih.gov 방문 요망

* 출처 : 보도자료(2016년 7월 29일)
        (https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-led-researchers-develop-software-could-facilitate-drug-development)

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