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인프라동향

데이터 및 임상정보의 공유를 촉진하기 위해 새롭게 착수된 Genomic Data Commons

  • 등록일2016-06-14
  • 조회수5851
  • 분류인프라동향 > 기타 > 기타
  • 자료발간일
    2016-06-06
  • 출처
    생명공학정책연구센터
  • 원문링크
  • 키워드
    #임상정보
  • 첨부파일

 
데이터 및 임상정보의 공유를 촉진하기 위해 새롭게 착수된 Genomic Data Commons

- 국가 암 달로켓발사의 일부로 접근가능한 데이터의 중앙집중 및 표준화를 위한 GDC

 

 


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【그림설명】국립 암 연구소 Genomic Data Commons 표제

    * 제공 : 국립 암 연구소

 

□ 게놈 및 임상 데이터의 연구자 간 공유를 촉진하는 통합된 데이터 시스템인 Genomic Data Commons(GDC)가 부통령 Joe Biden의 시카고 대학 운영센터 방문과 함께 금일 착수

 

  ㅇ 국립 암 연구소의 이니셔티브인 GDC는 국가 암 달로켓발사 및 대통령의 정밀의학 이니셔티브(PMI)의 중심 요소가 될 예정이며 종양학을 위한 PMI의 일부로써 암 유전체학의 노력을 국립 암 연구소가 선도하도록 배정된 7천만 달러를 지원받게 됨

 

  ㅇ GDC는 암 게놈 지도(TCGA*) 및 소아 암 게놈 지도, 효과적인 치료법을 만들기 위한 치료적으로 응용가능한 연구(TARGET**)와 같은 대규모 국립 암 연구소 프로그램들로부터 데이터를 중앙집중화, 표준화하고 데이터를 접근가능하도록 만들 계획

    * The Cancer Genome Atlas
    ** Therapeutically Applicable Research to Generate Effective Treatments

 

  ㅇ 국립 암 연구소는 국립보건원 산하

 

 

□ TCGA와 TARGET은 함께 세계에서 가장 크고 가장 광범위한 암 유전체 데이터 집합 중 상당부분에 해당되며 2 페타바이트* 이상의 데이터로 구성

    * 1 페타바이트는 데이터로 가득 찬 DVD 22만 3천장과 동일한 용량

 

  ㅇ 추가적으로 GDC는 전세계에 걸쳐서 그들의 데이터를 넓게 공유하고자 하는 연구자들로부터 암 유전체 및 임상 데이터 제출을 받아들일 예정

 

  ㅇ 이렇게 함으로써 연구자들은 그들의 발견들을 GDC의 다른 데이터들과 비교하도록 허용해 주는 GDC의 최신 분석방법들을 사용가능하게 될 전망

 

 

□ 수천 명의 암 환자들과 암들을 대표하는 GDC의 데이터들은 모든 암 연구자들에게 광범위하게 사용될 수 있고 접근가능하도록 표준화된 소프트웨어 알고리즘을 이용하여 조화될 예정

  ㅇ GDC의 유전체 데이터 원본의 보관은 계산 방법들 및 게놈 주석들이 개선됨에 따라 데이터 재분석도 가능하게 할 전망
  ㅇ 데이터 보안과 허가된 접근에 관한 고조된 관심의 시대에 GDC가 안전한 데이터 보관 및 다운로딩을 보장하는 중요한 안전장치들을 가지고 있다는 점은 중요하게 주목할 만함

 

 

□ 국립 암 연구소 대리책임자 Douglas Lowy 박사는 GDC로써 국립 암 연구소는 암 유전체 데이터의 장기간 보관을 유지하고 이들 데이터에 연구자들이 자유롭게 접근할 수 있도록 주요한 기여를 했다고 언급

  ㅇ 중요하게도 GDC의 데이터의 설명하는 힘은 보다 많은 환자들로부터 데이터가 포함될수록 시간이 감에 따라 증가할 것이고 궁극적으로는 GDC가 정밀의학에서의 우리의 노력들을 촉진하게 될 것이라고 강조

 

 

□ GDC는 메릴랜드주 프레데릭 소재 Leidos Biomedical Research와의 국립 암 연구소 계약 하에서 Ontario 암 연구소와의 협력으로 시카고대학교의 데이터 집약적인 과학 센터에 의해 구축되고 관리

 

 

□ 국립 암 연구소 Louis M. Staudt 박사는 특히 중요하게 GDC는 국립 암 연구소 임상시험들에 등록된 환자들의 DNA 염기서열을 분석하게 될 새로운 국립 암 연구소 프로그램들 다수로부터 데이터를 수집?보관하게 될 예정이라고 언급

  ㅇ 이들 데이터집합들은 어떤 치료들이 개별 암 환자들에게 가장 효과적인지에 관한 보다 깊은 이해로 이끌게 될 전망이라고 언급

  ㅇ 각각의 데이터들 추가로 GDC는 암 연구에서 중요한 발견들을 육성하고 환자들을 위한 암 치료법의 성공을 증가시키는 보다 똑똑하고 보다 광범위한 지식 시스템으로 진화하게 될 것이라고 강조

 

 

□ GDC가 암을 위한 광범위한 지식 시스템을 위한 토대를 마련하기를 희망

  ㅇ GDC 연구자들은 암 이미징 및 조직학적인 데이터와 같은 유전학적 및 임상 데이터를 치료반응과 함께 암들의 분자 프로파일에 관한 정보와 통합할 수 있게 될 전망

  ㅇ 이러한 측면에서 GDC는 궁극적으로 의사들과 그들의 환자들에 의해 사용될 수 있는 잠재적으로 실행가능하고 인생을 바꾸는 정보들을 생산하기 위한 중요한 원천이 될 것으로 예상

 

 

★ 국립암연구소는 국가적인 암 프로그램을 이끌면서 암의 발생을 극적으로 감소시키고 암 환자 및 그들의 가족들의 삶을 개선하기 위해서 예방, 종양 생물학, 새로운 치료법의 개발, 연수 및 새로운 연구자에 대한 지도 등을 수행

 - 암에 대한 보다 많은 정보가 필요하다면 국립암연구소 웹주소(http://www.cancer.gov)를 방문하거나 국립암연구소 정보 서비스, 1-800-4-CANCER로 전화하기 바람

 

★ 미 국립보건원에 대하여 : 미 국립보건원은 국가에서 설립한 의료 연구기관으로 27개 연구소와 센터로 구성

 - 기초, 임상 및 중개 의료 연구를 지원하는 주요 연방기관이며 질환들의 원인, 대처 및 치료를 연구

 - 보다 많은 정보가 필요한 경우 www.nih.gov 방문 요망

 


* 출처 : 보도자료(2016년 6월 6일)
        (https://www.nih.gov/news-events/news-releases/newly-launched-genomic-data-commons-facilitate-data-clinical-information-sharing)

 

 

 

 

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