바이오인

BioINwatch(BioIN+Issue+Watch): 17-67

10,000개의 식물, 진핵 미생물 유전체분석 계획

◇ 중국 BGI와 중국국립유전자은행(CNGB)은 식물과 진핵 미생물의 주요 분류군을 대표하는 10,000여개의 유전체를 분석하는 10KP 계획을 논의하기 위한 워크숍을 개최. 10KP는 ‘Earth BioGenome Project’의 핵심으로, 나아가서는 지구상 모든 생물체의 유전체 염기서열 분석을 목표로 함

    ▸주요 출처 : Science, Plant scientists plan massive effort to sequence 10,000 genomes, 2017.7.27.; 생명공학정책연구센터 BioINwatch 17-46, 지구상 모든 생물체 유전체분석 프로젝트, 2017.6.27

■ 식물 및 진핵미생물 주요 분류군 10,000여개 유전체 분석 추진
 
 ○ 세계 최대의 유전체분석 업체인 BGI(Beijing Genomics Institute)와 중국 국립유전자은행(China National GeneBank, CNGB)은 국제식물학회(International Botanical Congress)에서 10KP 계획에 대해 논의하기 위한 워크숍 개최(2017.7.26)
  - IBC2017은 중국 심천에서 7월 23∽29일 개최, 26일 ‵An Invitation to Sequence 10K (or more) Plant Genomes′ 주제의 워크숍에 250여명의 식물학자들이 토론에 참석

 ○ 10KP 계획은 지구생물 총 유전체 프로젝트(Earth BioGenome Project, EBP)*의 핵심 부분으로, 모든 주요 식물 분류군과 일부 진핵 미생물을 포함하여 적어도 10,000개의 유전체를 분석하는 것을 목표 
     * 지구생물 총 유전체 프로젝트(EPB)는 지구 상의 모든 생물체 DNA 염기서열 분석을 추진하자는 내용으로, 식물, 동물, 아메바와 같은 단세포 동물을 포함하는 진핵생물의 모든 과(family)에 속하는 생물 9,000여 종의 유전체 서열을 인간게놈 분석 수준 이상으로 정밀하게 분석. 마지막 단계에는 약 150만 종류에 달하는 모든 진핵생물 종(species)의 대략적인 유전체 서열 정보를 분석하는 계획이 포함

 ○ 또한 10KP 계획은 2012년 시작되어 종료를 앞두고 있는 1,000 plant (1KP) tranome 프로젝트를 기반으로 함
    ※ 1000 plants(oneKP or 1KP) 프로젝트는 1,000여 종의 식물 종에 대한 대규모 유전자 분석을 추진하는 다학제간 국제컨소시움으로, 연구책임자는 알버타 대학의 Gane Ka-Shu Wong이 맡음
  - 1KP 프로젝트는 작물과 모델 생물뿐만 아니라 계통발생학적으로 다양성을 추출하는 것으로 목표로 함. 현재까지 50여편 이상의 논문을 발표하였으며, 대부분의 분석은 식물 진화에 초점이 맞춰져 있음

■ 10KP 계획의 추진사항 및 해결과제

 ○ 10KP는 1KP 프로젝트(tranome 또는 생물체에서 발현된 mRNA를 다룸) 달리 전체 게놈의 완전한 염기서열분석 결과를 제공할 것임
  - 과학자들은 이를 통해 근본적인 통찰력과 경제적인 이익을 얻을 수 있는 bonanza(보고)가 될 것으로 기대
    ※ 플로리다 대학 자연사 박물관(Florida Museum of Natural History)의 식물생물학자인 Douglas Soltis는 “10KP project is 1KP on steroids(10KP는 1KP의 새롭게 업그레이드 된 것)”라고 말함
    ※ 또한 이 프로젝트의 최대 장점은 비모델 시스템 식물을 연구하는 수많은 식물학자들에게 참고게놈을 제공하는 것이라 말함
  - 연구 목표에는 게놈 복제의 역할, 게놈 및 형태학적 변화 간의 상관관계, 시간경과에 따른 진화속도의 변화가 포함될 것으로 예상
    ※ 미시건 대학의 Stephen Smith는 10KP 계획은 “식물 진화에 관한 근본적인 문제를 해결할 수있는 전례없는 기회"라고 덧붙임

 ○ 전문가들은 10KP 추진을 위해서 몇 가지 해결해야할 문제가 있다고 지적
  - ScienceInsider는 전 세계에게 식물 표본을 선적할 수 있도록 많은 양의 데이터 및 서류작업을 처리할 수 있는 새로운 도구가 필요하다고 제시
  - 미시건 대학의 Stephen Smith는 기존의 도구와 방법으로 엄청난 양의 데이터를 처리할 수 없다고 판단하여 시퀀싱 정보를 분석하고 합성하는 새로운 방법을 개발할 필요가 있다고 제안

 ○ 자금 부분은 BGI와 CNBG가 유전체분석에 소요되는 비용을 담당하고, 샘플 채취와 분석을 위한 자금은 연구자들이 자체적으로 마련할 계획
  - 알버타 대학의 Gane Ka-Shu Wong은 향후 2년 내에 샘플을 모으고, 5년 내에 시퀀싱 및 분석을 수행할 계획이라 밝힘
  

    ※ 또한 Gane Ka-Shu Wong은 유전자원의 공정하고 공평한 공유를 보장하고자 하는 국제협약인 나고야 의정서를 준수할 뿐만 아니라 국경을 넘어선 식물 재료 운송에 대한 법적 요구사항을 준수하는 데 필요한 서류작업이 또 하나의 병목이 될 것이라고 함

...................(계속)

바이오 분야의 국내외 이슈를 살펴보기 위해 작성한 BioINwatch는 국내외 다양한 분석 보고서, 언론 기사 등을 참고하여 작성되었으며, 생명공학정책연구센터의 공식 견해는 아닙니다. 본 자료는 생명공학정책 연구센터 사이트(http://www.bioin.or.kr)에서 다운로드가 가능하며, 자료의 내용을 인용할 경우에 출처를 명시하여 주시기 바랍니다.

☞ 자세한 내용은 내용바로가기 또는 첨부파일을 이용하시기 바랍니다.

☎ 해당 사이트 링크가 열리지 않을시 Bioin 담당자(042-879-8377, bioin@kribb.re.kr)에게로 연락주시기 바랍니다.