바이오인

▣ Common Fund Data Ecosystem(CFDE)은 다양한 NIH Common Fund 프로그램들의 데이터에 접근하고 활용할 수 있도록 노력 

 ○ 미국 NIH는 산하 여러 연구기관의 R&D 활동에 공통적으로 큰 파급효과를 나타내는 분야에 대해 Common Fund(공통연구비) 프로그램을 운영

  - NIH 내 벤처캐피털 기능을 하며 단기적(5~10년) 추진으로 바이오 연구에 혁신적인 영향을 미치는 아이템에 전략적으로 투자

    ※ 2021년 예산은 6억 4,850만억 달러(약 7,560억원)으로 현재 4D Nucleome (4DN), Glycoscience, Cellular Senescence Network(SenNet), Extracellular RNA Communication, Somatic Cell Genome Editing(SCGE) 등 30여 개의 프로그램들이 추진 중. Common Fund Data Ecosystem(CFDE)도 포함 

 ○ Common Fund 프로그램마다 생성되는 데이터의 저장 및 관리 방식이 달라 여러 데이터 세트를 연계하여 분석하는 것이 불가능한 실정 

  - 대부분의 프로그램 목표는 논문 발표로 데이터의 구성, 구조, 엑세스, 유용성, 검색 가능성 및 재사용성에 관심을 기울이지 않아 프로그램 간에 데이터를 재사용하는 것은 불가능한 경우가 많음

  - 이에 Common Fund 프로그램 간 데이터 사용을 촉진하여 바이오 연구를 발전시키기 위해 Common Fund Data Ecosystem 프로그램을 추진

▣ Common Fund Data Ecosystem은 바이오 연구의 새로운 개척 분야로, 혁신적인 협업은 과학적 발견을 위한 유용한 도구로 기대 

 ○ Common Fund Data Ecosystem(CFDE)은 디지털 클라우드 환경에서 여러 Common Fund 프로그램 데이터 세트에 접근하고 활용할 수 있는 온라인 포털을 개발 중  

  - CFDE 포털은 Common Fund 데이터 세트를 FAIR(Findable, Accessible, Interoperable, Reusable)로 만들고 연구자가 단일 액세스 지점에서 과학적 및 임상적 질문을 할 수 있도록 공유 리소스를 생성하여 이 문제를 해결하는 데 도움 

  - CFDE 코디네이팅센터(CFDE-CC)는 CFDE 활동을 관리 및 조직, 사용자 커뮤니티 연결, 교육 지원, 도구 및 표준 개발 및 전문적 지식을 제공하는 역할을 수행

    ※ CFDE-CC로 University of Maryland-Baltimore 지정(2019년)

▣ CFDE는 데이터 생태계를 지속 개발하고 성장시키기 위해 Common Fund DCC(Data Coordinating Centers)에 자금을 지원 

 ○ DCC 간 추가 파트너십 프로젝트에 자금을 지원하여 기능적인 생태계를 구축

  - 최근 Glycoscience, 4D Nucleome(4DN) 프로그램이 합류하여 10개의 DCC가 참여

    ※ Extracellular RNA Communication(ExRNA), Gabriella Miller Kids First(Kids First), Genotype-Tissue Expression(GTEx), Human BioMolecular Atlas Program (HuBMAP), Illuminating the Druggable Genome(IDG), Library of Integrated Network based Cellular Signatures(LINCS), Metabolomics, Stimulating Peripheral Activity to Relieve Conditions(SPARC)

 ○ Common Fund DCC는 CFDE-CC와 함께 기본 메타 데이터를 조율하여 CFDE 포털에 데이터 세트를 제공

  - DCC 전반에 걸쳐 통찰력과 지식을 공유하는 문화 형성 및 CFDE 전체 교육 및 지원 활동에 기여하기 위한 프로세스 개발을 지속

  - DCC 간 파트너쉽(협력)을 통해 교차 데이터 세트 분석이 가능하도록 데이터와 워크플로우를 조화시키는 접근 방식과 도구를 개발

  - 이러한 협력 프로젝트는 바이오의료 연구 및 인간 건강의 중요한 문제를 해결할 수 있는 새로운 통찰력을 줄 수 있을 것으로 기대 

 ○ Common Fund DCC 간의 협력 프로젝트가 아래와 같이 추진 중이며, 최근 6개의 새로운 DCC 파트너십 프로젝트에 자금을 지원 

  - 복잡한 조건에 대한 새로운 통찰력(Novel insights into complex conditions):　다운증후군과 같은 복잡한 상태를 연구하기 위한 강력한 도구를 만들기 위해 발달 중 유전적 돌연변이, 구조적 선천적 결함 및 유전자 활동 변화를 통합할 multi-layered organ maps 생성　

    ※ 참여 DCCs : ExRNA, HuBMAP, Kids First, SPARC 　

  - 소아암 치료를 위한 새로운 신약 표적(New drug targets for pediatric cancer treatments): 종양과 건강한 장기 조직 간의 유전자 활성 차이를 비교하여 특정 유형의 소아암에 대한 새로운 잠재적인 치료 표적을 확인 

    ※ 참여 DCCs : GTEx, Kids First, LINCS

  - 데이터 기반 치료 계획을 위한 혁신적 전략(Innovative strategies for data- driven treatment planning): 약물 및 소분자 예측을 환자 유전자 활성 데이터와 결합하여 주요 분자 경로를 밝히고 효과적인 치료 전략 개발, 약물 반응 예측, 특정 환자에 대한 최상의 후보 약물 식별, 질병 진행 및 회복 추적에 도움

    ※ 참여 DCCs : GTEx, IDG, Kids First, LINCS, Metabolomics