바이오인

분리하고 측정하고 깨뜨려라: 액체크로마토그래피-탄뎀질량분석기를 이용한 프로테오믹스

김 진 영
한국기초과학지원연구원(생의학오믹스연구부)

축구공，배구공，럭비공을 비롯한 수많은 여러가지 공으로 가득찬 방을 상상해 보자. 공을 눈으로 보거나 만지거나 할 수는 없다. 단지 그림자만 관찰할 수 있는 상황에서 그 방이 어떤 공들로 채워져 있는지 알아내야 한다.

어떻게 해야할까? 나름의 여러가지 방법이 있을 것이다. 우선 그림자를 볼 수 있다고 했으니 능구공이나 골프공처럼 동그란 공인지，럭비공처럼 길쭉한 공인지 아니면 하키공처럼 납작한 공인지 나누어 볼 수 있을 것이다. 그 다음은 모아놓은 동그란 공들의 크기를 가늠해 보자. 탁구공，골프공 은 작을 것이고，배구공，축구공，볼링공은 클것이고，야구공，테니스공, 당구공은 그 중간쯤 할 것이다. 이제，비슷비슷한 중간크기의 동그란 모양 공들에 대해 정체를 밝혀야 할 일이 남아있다. 여러분이라면 어떻게 하시겠는가? 아  날도 더운데 왜 자꾸 재미도 없는 질문을 하지? 확 던저버리고 싶다.

“딩동댕! 정답입니다.” 마지막으로 우리가 할 일은 공을 던져 벽에 부딪히고 그들의 움직임을 보는 것이다. 벽을 향해 힘껏 던저보자. 테니스 공은 탱~하고 멀리 날아갈 것이고，야구공 은 딱  소리와 함께 날아갈 것이고，당구공은 뻑~ 소리를 내며 벽을 금가게 하고 어디론가 굴러갈지도 모르겠다. 어찌되었건 충돌은 공의 재질에 따른 특성을 보여줄 것이고 우리는 그것이 어떤 공이었음을 알게 된다.

서론이 길었다. 이제 공놀이는 그만하고 공으로 채워졌던 그 방을 우리가 사랑하는 단백질로 채워보자. 그리고 어떤 단백질이 있는지，옆방과 비교해서 어떤 단백질들이 변했는 지 알아보기로 하자. 어떻게? 같은 방법이다. 분리하고，측정하고, 깨트리자. 이런 일을 전문가들은 단백체학 또는 프로테오믹스 (proteomics) 라고 부른다. 이 일을 가장 잘 할 수 있는 분석장비는 액체크로마토그래 피-탄뎀 질량분석기 (LC-MS/MS) 이다.

...................(계속)

☞ 자세한 내용은 내용바로가기 또는 첨부파일을 이용하시기 바랍니다.