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세포 고정 후 단일세포 염기서열 분석

◈ 목차

1. 개요

2. 주요 내용

 2.1. 단일세포 시퀀싱

 2.2. 고정 단일세포 시퀀싱 기술의 응용

 2.3. 임상에서의 고정 단일세포 시퀀싱 기술의 적용

 2.4. 파라핀 포매 조직을 이용한 고정 단일세포 시퀀싱

3. 결론 

◈본문

요약문

지난 10 년 동안 단일세포 염기서열 분석 기술은 인간의 건강과 질병을 유발하는 생물학적 시스템을 더 깊게 이해할 수 있게 만들어 주었다. 단일 세포 RNA 시퀀싱 기술의 발전을 이용하여 과학자들은 면역학, 암, 신경과학 및 다른 많은 연구 분야에 활용하고 있으며 희귀 세포 유형의 분화 및 발견, 다양한 이질성을 분석할 수 있는 해상도로 발전하고 있다. 하지만 샘플 취취 시가나 장소로 인해 많은 어려움을 가지고 있어 이러한 샘플을 보존하고 원래의 샘플 품질을 유지할 수 있는 고정법 및 이 고정 세포를 이용한 단일 세포 염기서열 분석은 세포 트랜스크립토믹스에 획기적인 발전을 가져다 줄 것이다. 따라서, 단일 세포 고정 염기서열 분석법은 더 많은 샘플에 대한 접근성을 향상시키고 보존하며 기존에 문제로 지적되어온 물류 문제를 극복하기 위해 개발되었다. 고정을 이용한 단일 세포 기술의 이러한 중요한 발전을 통해 과학자들은 생리학 및 병리학에 영향을 미치는 분자 변화를 조사하여 질병 진행 및 치료를 이해하는 방식을 변화시켜주고 있다.

1. 개요

단일세포 RNA 염기서열 분석(single cell RNA sequencing)은 세포 특이적 발현 프로파일을 분석하는 데 가공, 샘플의 신선도 및 보전 등 제한적 요인이 존재한다. 즉각적이고 정확한 샘플의 처리는 단일세포 RNA 염기서열을 분석하는 데 중요한 성공 요인으로 접근 방식이 매우 제한적이다. 이러한 제한된 샘플 처리 과정을 배재하기 위해 세포 고정 후 염기서열 분석이라는 방법이 제안되고 있고 상용화되고 있다. 특히 고가의 세포 분류 장비 등을 사용할 경우 진행 과정의 번거로움과 샘플 변형 등으로 인한 시퀀싱 품질 저해를 막고 살아 있는 세포를 가능한 많이 원래 상태로 보존하는 방법은 무한한 이점을 지니게 된다. 특히, 많은 종양 조직 및 조직에서 세포를 분리하기 어려워 다양한 전처리가 필요한 샘플의 경우 세포 생존력에 부정적인 영향을 주어서 전체 시퀀싱 데이터의 질에 많은 문제점을 수반한다. 따라서 세포 RNA 를 성공적으로 보존하고 후속 처리를 가능하게 하는 방법은 세포 분류 및 단일세포 RNAseq 을 적용하는 데 큰 이점을 보일 수 있을 것이다.

...................(계속)

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