부처연구성과
단백체 지식기반 정보 시스템「EcoProDB」구축
- 등록일2007-10-16
- 조회수8632
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성과명
단백체 지식기반 정보 시스템「EcoProDB」구축
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연구자명
이상엽 특훈교수
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연구기관
KAIST 생명화학공학과
- 사업명
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지원기관
과학기술부
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보도자료발간일
2007-07-31
- 원문링크
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키워드
#EcoProDB #단백체 지식기반 정보 시스템
- 첨부파일
단백체 지식기반 정보 시스템 EcoProDB 구축_보도자료.hwp
핵심내용
상세내용
단백체 지식기반 정보 시스템「EcoProDB」구축
- 단백질들이 환경에서 변화하는 모습을 한눈에 파악 가능-
다양한 유전적, 환경적 조건 하의 대장균 단백체 정보와 이차원 전기영동을 통해 얻어진 단백질 발현 지도를 손쉽게 비교 및 분석, 검색할 수 있는 지식기반 정보 시스템인 EcoProDB(이코프로디비)가 국내 기술진에 의해 구축됐다.
과학기술부는 KAIST 생명화학공학과 이상엽(李相燁, 43세, 특훈교수/LG화학 석좌교수) 교수 연구팀이 EcoProDB(이코프로디비)를 개발하고 영국 옥스퍼드대학 출판사가 발간하는 생물정보학 분야 전문 학술지 바이오인포메틱스(Bioinformatics)지에 7월 10일 게재되었다고 31일 발표했다.
이상엽 교수 연구팀은 지난 30여 년 간 가장 많이 연구되고 응용되어 온 대장균의 단백질 수준에서의 발현과 단백질 상호작용에 대한 정보를 체계적으로 정리함으로써 산업적 균주에 대한 이해도 제고는 물론 대상 균주를 효율적으로 개량하고 이용하는데 중요한 정보를 제공할 수 있게 되었다.
특히 이제까지 발표된 이차원 전기영동 지도를 수집하여 한눈에 여러 조건하의 연구 결과와 발현 양상을 파악할 수 있도록 하였으며, Ajax와 같은 최신 IT 기술을 활용하여 대화형 정보 교환 환경을 구축함으로써 복잡한 정보를 비교, 분석할 수 있도록 하였다.
EcoProDB는 이차원 전기영동 지도 외에도 예상 단백체 지도, 세포내 발현위치, 기능적 분류, 단백질 각각의 발현양상, 단백질 각각의 조건에 따른 양적변화 등 관련 정보 뿐만 아니라 사용자가 직접 자신의 실험결과를 DB와 비교분석 할 수 있는 등의 다양한 도구들도 제공하고 있다.
이상엽 교수는 “EcoProDB 구축을 통해 단백체 정보를 보다 종합적으로 분석, 해석하는 것이 가능해졌으며, 지난 수십년간 축적된 대장균 단백체 분석 결과를 통해 단백질들이 어떠한 환경에서 어떻게 변화하는지를 한눈에 파악할 수 있게 되었다"고 설명했다.
이상엽 교수팀은 이번 개발성과를 통해 미생물 단백체 연구에 한 발짝 더 나아가게 되었으며, 향후 지속적인 업그레이드를 통해 기초연구 뿐 아니라 산업적으로도 유용한 미생물 단백질 데이터베이스가 되도록 성장시켜 나가겠다고 포부를 밝혔다.
현재 EcoProDB 지식기반 정보 시스템은 홈페이지(http://eecoli.kaist.ac.kr)를 통해 접근이 가능하다.
붙임 : 1. 이상엽 특훈교수 이력서
2. EcoProDB 주요 화면 캡처 사진 4매
3. 용어설명
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