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지구 RNA 바이롬(virome) 진화의 기원을 설명할 해양 바이러스

  • 등록일2022-06-10
  • 조회수2949
  • 분류생명 > 생명과학,  플랫폼바이오 > 바이오기반기술
  • 발간일
    2022-06-09
  • 키워드
    #해양#RNA#바이롬 #virome#진화
  • 첨부파일
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 BioINwatch(BioIN+Issue+Watch): 22-40

지구 RNA 바이롬(virome) 진화의 기원을 설명할 해양 바이러스


◇ Tara Ocean 프로젝트를 통해 5대양 121정점(location)에서 채취한 해수 시료에서 6686개 해양 RNA 바이러스 RdRp(RNA-directed RNA polymerase) 유전자 염기서열을 발견본 염기서열의 계통학적 분석 결과, 5개문 (phylum)을 신규 제안하며 전체 RNA 바이러스를 10개문으로 개정그중, Taraviricota를 바이러스 진화 과정을 설명해 줄 분류군으로 판단

주요 출처 : Science Vol 376, Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome, 2022.4.7


 지구상 모든 생명체의 진화에 깊이 관여하는 RNA 바이러스는 종분화 (speciation)를 이끄는 기폭제로서 역할을 할 것으로 추


 ○ RNA 바이러스는 숙주 생물 유전체에 돌연변이를 일으켜 수명유전자 흐름대사물질 변화 및 종분화(speciation)를 유도할 것으로 추측

   - RNA 바이러스는 최초 공동조상(last universal celluar ancestor, LUCA) 이전에 지구상에 존재했으며복수의 기원을 가질 것으로 예


 

RNA 바이러스 설명

 

 

 

 ◈ RNA 바이러스란?

리보핵산(ribonucleic acid, RNA)으로 구성된 게놈을 가진 바이러스

게놈 복제를 위해 RNA 의존성 RNA 중합효소(RNA-dependent RNA polymerase, RdRp)를 유전자로 암호화

 

◈ RNA-dependent RNA polymerase(RdRp)

RdRp는 RNA 바이러스 게놈을 메신저 RNA로 전사하고게놈 복제하는 데 사용

이 단백질은 RNA 바이러스가 증식하는 데 필수적인 것으로 RNA 바이러스에서 공통적으로 확인되는 유일한 단백질로 보존성이 높음

 

◈ 읽어버린 고리(missing link)

생물 진화의 역사를 나타내는 하나의 계통수를 완성하는 과정에서 아직 밝혀지지 않은 부분


출처 : Science Vol 376, Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome, 2022.4.7




 ○ 특히 해양 RNA 바이러스의 다양성이 두드러지는데, Tara Ocean 프로젝트 통해 5대양 121정점(location)에서 6686개 RdRp(RNA-directed RNA polymerase) 유전자 서열을 확보

   - 5대양 121정점에서 채취한 해수 시료를 대상으로 한 RNA 메타트랜스크립톰 (metatranscriptome) 분석에서 6686개 RdRp 유전자 서열 확보


 ○ 이를 통해 RNA 바이러스 분류군에 5개의 새로운 문(new phyla)과 최소 11개의 새로운 강(new classes)을 추가

   - 해양 RNA 바이러스의 생물지리학적 연구에 따르면Taraviricota라는 새로운 문(phyla)에서 최소 220여개 vOTU(virus operational taxonomic units; a species-rank approximation)를 신규 발견

   - 이 문에 속하는 RNA 바이러스는 온대 및 열대 수역 전역에서 광범위하게 나타나며 다양성 또한 높음에도 불구하고생태학적 중요도가 간과됨


▣ 이번 연구를 통해 초기 RNA 바이러스 진화의 읽어버린 고리로 추정되는 Taraviricota를 발견


 ○ 그동안 DNA 바이러스, RNA 바이러스레트로분자 사이의 진화적 관계에 대한 해답을 찾지 못하고 있었는데,

   - 이번 연구의 RdRp 분석을 통해 orthornaviran RNA 바이러스(+ssRNA, -ssRNA, dsRNA)가 공통 조상에서 기원함을 규명

   - 또한 Taraviricot가 RNA 바이러스의 초기 기저 계통군(basal lineage)에 해당하며레트로분자(retroelements)와 공통 조상(common ancestor)에서 기원한 것으로 추정


개정된 RNA 바이러스 10개문과 RdRp 3차 구조 유사성 네트워크 >



개정된 RNA 바이러스 10개문과 RdRp 3차 구조 유사성 네트워크

출처 : Science Vol 376, Cryptic and abundant marine viruses at the evolutionary origins of Earth’s RNA virome, 2022.4.7


...................(계속)

 

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